Научно-аналитическая деятельность ЦКП «Аналитическая спектроскопия» основана на является центром коллективного пользования распределенного типа, структуру которого образуют следующие лаборатории:

1. Лаборатория структурного анализа.
2. Лаборатория оптической и лазерной спектроскопии.
3. Лаборатория физико-химических методов анализа.
4. Лаборатория молекулярной биологии.
5. Лаборатория экологического мониторинга.
6. Лаборатория синтеза полупроводниковых наноматериалов и тонких пленок.